如果太陽熱水器在運行中產生水垢，會嚴重地影響系統的運行效率和使用效果。所以，太陽熱水器除垢十分重要。下面介紹幾種除垢方法。

    磁化除垢法

    磁化法水處理是使水流通過一個磁場，然后再流入管道或太陽熱水器系統，經過磁力線切割后，水中的鈣鎂鹽類不能結垢或不能結成堅硬的水垢，而是形成微小的顆粒，隨水流動。

    磁化除垢是通過磁化方式將已有的水垢清除的過程。磁化除垢的機理有兩個方面：一方面是在磁力作用下，水垢晶體發生極化，降低了水垢的穩定性，使得水垢被不斷地溶解，被水流沖走：另一方面，流經磁化處理器的水的PH值值減少，這說明磁化增加了CO2在水中溶解度，抑制了CaCO3、Mg(OH)2新垢的形成，并溶解了已有的水垢。

    靜電除垢法

    靜電水垢控制器是利用一定強度的靜電場進行水處理的設備。當水通過靜電水垢控制器時，水在其電場的使用下產生極化，并使水偶極子的正極端趨向靜電場的陰極，負極端趨向靜電場的陽極，且按正負的次序被整齊地排列起來；當水中含有溶解鹽時，這些鹽類的正負離子就被若干水偶極子所包圍，使其不能在水中自由游動，這樣，這些溶解鹽的離子就不能接觸器壁，因而達到控制水垢生成的目的。裝置中已經存在的水垢，因水的極化作用，使水分子趨向器壁，從而使老垢龜裂、變形、逐漸脫落。當水垢已變堅實時，水能夠進入金屬與水垢層之間，水垢徐徐溶解，直到完全除去。

    變頻共振除垢法

    變頻除垢器能自動產生一種變頻化的電信號，作用于太陽熱水器系統的進水管上，引起管道內水分子產生共振，使氫鍵結合的水分子團變成單個的極性分子，因而提高水的活性。極微小的水分子可以滲透、包圍、溶解、去除熱水器系統內的老垢，同時使懸浮在水中的鈣離子和碳酸根離子相互碰撞，形成其表面無電荷的紋石碳酸鈣晶體，不能吸附在管道上，從而達到除垢、防垢的目的。

    聲學除垢法

    聲學除垢技術是在太陽能熱水系統的設備內部激發和維持聲頻震蕩，同時將聲波傳遞給水介質進行除垢。超聲波（1200～2500HZ）能使管道及設備的舊積垢逐漸剝落，并使硬度鹽在水中結晶、并生成無粘性的粉末沉淀。